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蛋白质测序已经应用于众多领域,但很多老师开展实验前存仍在诸多疑问,本文总结了蛋白质测序的常见问题供大家参考。
Q1:蛋白测序和基因测序的区别?
我们的蛋白测序是氨基酸水平的,基因测序是核苷酸水平的。通过我们的蛋白测序可以在不知道核苷酸序列的情况下(或者是没有参考数据库的情况下),给出蛋白质的完整氨基酸序列。
Q2:蛋白从头测序和N端测序的区别?
蛋白质N端测序一般只能检测10-20个氨基酸,后面的序列就测不出来了。我们公司独有的蛋白质从头测序技术平台可以对蛋白质的所有氨基酸进行准确且快速的检测。
Q3:蛋白测序是否能确定鉴定的肽段是来源于人,还是微生物?
可以确定鉴定到的肽段的物种到底是人还是微生物,可以通过物种的unique肽段来进行鉴定分析。
Q4:抗体测序需要的样本量?血清中混合抗体不经纯化能测出序列?
在抗体纯度符合要求的情况下,单抗测序只需要100μg的抗体蛋白即可完成测序。血清中的混合抗体测序比较复杂,需要进行相应的评估来确定。
Q5:蛋白测序是只给出重链序列吗?是只检测可变区序列吗?
我们是全序列从头测序,报告完整的氨基酸序列,包括重链,轻链,包括可变区和恒定区。
Q6:蛋白测序酶解使用的酶是?
我们一般使用5-8种酶,比如说常见的Trypsin, Chymotrypsin等。
Q7:蛋白质测序使用的质谱仪是?
我们采用的是Thermo Scientific的高精度高分辨率的Orbitrap Eclipse三合一质谱仪。
Q8:抗体蛋白测序周期是多久?
1个样本的标准服务周期是一周左右,最快记录是26h。可以提供加急服务。
Q9:蛋白测序的准确度是?
我们迄今为止已经累计完成近7000个项目。单个项目氨基酸序列的准确率可以做到100%,序列报告中每一个氨基酸均被 30 个甚至更多的不同的重叠肽谱匹配。
Q10:蛋白测序能分析翻译后修饰吗?
可以的,我们的软件能够鉴定到多种常见的翻译后修饰,且可以提示修饰位点。
关于Rapid Novor快序生物
蛋白质是生物功能的主要载体,如果能像基因测序一样直接破译蛋白的一级结构,对了解生命活动的分子机制具有重大意义。
Rapid Novor快序生物一直致力于无需基因序列的蛋白从头测序技术,是全球首个提供单克隆抗体自动化测序服务的公司。目前Rapid Novor快序生物拥有全球最大的商业化蛋白质组学质谱平台,是蛋白从头测序技术的领跑者。Rapid Novor快序生物的蛋白从头测序技术已被应用于多发性骨髓瘤MRD监测,可以直接对人血清高浓度单克隆免疫球蛋白进行测序,并获得美国CLIA临床认证。Rapid Novor快序生物在中国提供的服务包括:抗体测序,抗体开发,肿瘤新抗原鉴定服务等。