肿瘤新抗原质谱鉴定常见问题

肿瘤新抗原作为蛋白质测序技术的一种全新应用场景，很多老师们还存在很多疑问，本文总结了肿瘤新抗原鉴定的常见问题供大家参考。

Q1:肿瘤新抗原服务具体是做什么？

肿瘤细胞表面的MHC I能够呈递具有高度特异性的肽段，称为肿瘤新抗原(neoantigen)。由于在正常细胞中并不表达，因此这类肽段是肿瘤免疫治疗和肿瘤疫苗的理想靶点。我们的肿瘤新抗原质谱鉴定服务可以从客户提供的细胞或者组织样品中利用质谱鉴定技术和肽段从头测序技术鉴定出肿瘤新抗原。这些鉴定到的新抗原肽段可以作为免疫治疗的靶点。

Q2:请问什么是免疫沉淀？

免疫沉淀（Immunoprecipitation, IP）是利用抗体特异性富集目的蛋白的一种方法。在我们的新抗原质谱鉴定服务中，抗体首先被固定在固相载体上，而后与细胞裂解液中的MHC I蛋白结合，不相关的污染蛋白经洗涤后被除去。富集得到的MHC I蛋白被重悬于洗脱缓冲液，其上结合的肽段会与MHC I解离，被进一步纯化之后就可以用质谱仪进行分析了。

Q3:贵公司的肿瘤新抗原质谱鉴定对样品有什么要求？石蜡组织可以做吗？

肿瘤组织和肿瘤细胞都是可以的，最好的处理是新鲜样品进行液氮速冻。但对于已经做了石蜡包埋的样品，我们也是可以做的。

Q4:肿瘤新抗原质谱鉴定找到的肽段，是否能够匹配到突变的基因?

可以匹配到突变的基因，但是这需要提供基因组测序的数据。

Q5:测序的灵敏度有多高？必须有1*10的8次方个细胞么？

以我们自己的数据为例，1*10的8次方个细胞，经过一次免疫沉淀实验，可以鉴定到7000多个不同的肽段。由于不同细胞上的MHC I表达量不一样，因此要具体细胞具体分析，我们建议客户至少提供1*10的8次方个细胞。

Q6:新抗原送样检测的话大概多久可以拿到数据呢？

从我们收到样品到出具完整鉴定报告的时间是15个工作日。

Q7:贵公司肿瘤新抗原质谱鉴定服务的优势是？

1）更直接，不依赖于基因组测序结果；

2）更真实，用质谱仪鉴定从细胞中提取的肽段；

3）更多样，独有的De novo测序技术能够鉴定多种突变肽段；

4）更灵活，提供弱酸洗脱和免疫沉淀供客户选择。

关于Rapid Novor快序生物

蛋白质是生物功能的主要载体，如果能像基因测序一样直接破译蛋白的一级结构，对了解生命活动的分子机制具有重大意义。

Rapid Novor快序生物一直致力于无需基因序列的蛋白从头测序技术，是全球首个提供单克隆抗体自动化测序服务的公司。目前Rapid Novor快序生物拥有全球最大的商业化蛋白质组学质谱平台，是蛋白从头测序技术的领跑者。Rapid Novor快序生物的蛋白从头测序技术已被应用于多发性骨髓瘤MRD监测，可以直接对人血清高浓度单克隆免疫球蛋白进行测序，并获得美国CLIA临床认证。Rapid Novor快序生物在中国提供的服务包括：抗体测序，抗体开发，肿瘤新抗原鉴定服务等。